吃莲子的时候感到有苦味是因为莲子中间的青绿色胚芽没有清除干净，这种青绿色胚芽即莲子心，它性味苦寒，归心，肾经，有极好的药用功效。
莲子心主要含莲心碱、异莲心碱、甲基莲心碱、前荷叶碱、荷叶碱、牛角华塑、甲基紫堇杷灵、去甲基乌药碱，以及木犀草甙、金丝桃甙、芸香甙等黄酮类物质。其中前荷叶碱、牛角花素、甲基紫堇杷灵带有苦性，所以莲子心是苦的，成熟的莲子心尤为苦。莲心虽然味苦，其中所含生物碱却有药效，中医认为它有清心，去热，止血，涩精的药效，可治心烦，口渴，吐血，遗精，平和五脏之气。
若实在不喜莲子心的苦味，可去莲心后食用。去莲子芯的方法如下。
新鲜莲子去芯：用手将莲子掰开，取出莲子心；也可用牙签从莲子的底部将莲子心推出；干莲子去芯：先用水泡软莲子，再用小刀在莲子中间横划一圈，掰开莲子壳，取出整颗莲子，再用牙签从莲子中间穿过带出莲子心，拔出莲子心即可。
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