主要区别在于：地址不同、建立时间不同。
1、地址不同：
南昌站：江西省南昌市二七南路213号。
南昌西站：江西省南昌市红角洲。
2、建立时间不同：
南昌站：
南昌站始建于1935年；1959年，1997年先后新建了第二代和第三代站房；2005年10月，南昌站广场改造工程正式动工；2007年1月，南昌站西广场改造完工；2015年3月，南昌站东站房正式启动改造工程；2016年5月，南昌火车站东站房正式启用；2017年1月，南昌站西站房启用。
南昌西站：
2010年11月，南昌西站正式开工建设；2013年2月主体工程完工；2013年5月31日北广场封顶；2013年9月26日，南昌西站正式启用。
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