1、性质不同：公务员属于国家的政府部门的工作人员，无论是国家公务员还是在地区工作的公务员都是行政编制的工作性质；而事业编制属于科研单位、教育单位、文化单位，新闻、广播、出版单位等。
2、工资来源不同：公务员的工资全部是财政全额拨款；而事业编制的工资和活动经费的开支渠道除一般由国家事业费开支的外，还有部分事业单位的经费采取自收自支、差额补贴等办法。
3、升职机会不同：事业编制的工作人员升职的机会不大，因为事业编制的职位比较少；而一般的公务员升迁机会要大的多，还可以一直升官。
4、权限和范围不同：虽然公务员和事业单位同属于编制内人员，但公务员拥有的是公务员行政编制，而事业单位拥有的是事业单位编制。因此，二者的编制权限和范围不一样。
5、人员架构不同：公务员的级别由低到高，分别是办事员、科员、副科、正科、副处、正处和其他更高的职位；而事业单位一般分为管理岗位、事业单位的技术岗位、事业单位的工勤岗位。
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