发生农村宅基地纠纷的处理办法如下：
1、农户之间发生宅基地权属争议，当事人双方应尊重历史，相互谦让，协商解决问题。
2、协商不成的，当事人任何一方或双方可到当地乡(镇)政府或土地管理所等受理机关提出处理申请。
3、如果乡镇不受理，当事人双方可直接向县政府或国土局申请，若符合受理条件，可指定受理或直接受理。受理机关对受理的宅基地权属争议，可先行调解;调解无效的，应当作出处理决定。
4、当事人对处理决定不服的，可在收到处理决定通知之日起15日内向上一级处理机关申请复议，也可以在接到处理决定后30日内，直接向人民法院起诉。
根据《土地管理法》第16条第1款规定：土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。可以先找当地村委或者乡镇国土所工作人员进行调解。
根据《土地管理法》第16条第2款规定：个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
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