首先，自建房协议的签订应该依照法律规定进行。在签订自建房协议时，应该遵循《合同法》等法律法规的规定，明确双方的权利和义务，确保合法有效。同时，双方要对协议内容进行充分的了解和确认，确保协议内容的真实性和合法性。只有在合法的前提下，自建房协议才能具有法律效力。
其次，自建房协议应该经过公证或者认证。公证或认证可以证明协议的真实性和合法性，可以有效地保障双方的权益。在签订自建房协议时，双方可以选择公证或认证，以确保协议的有效性。同时，在协议的执行过程中，公证或认证机构也可以发挥重要的监督作用，监督双方履行协议的内容。
第三，自建房协议应该明确双方的权利和义务。在协议中，应该明确房屋的所有权、使用权、维修义务等内容，以及房屋的使用范围、用途等内容。同时，协议中应该明确双方的权利和义务，以及双方对协议违约的处理方式。只有在协议内容明确的情况下，协议才能具有法律效力。
第四，自建房协议应该遵循公序良俗。在签订自建房协议时，双方应该遵循公序良俗，不得违反法律法规和社会道德。例如，房屋的用途应该符合法律规定，不得违反相关法律法规；房屋的建设应该符合环保要求，不得破坏环境等。只有在遵循公序良俗的前提下，协议才能具有法律效力。
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