根据提供的信息，即使交纳了罚款，别墅类违章建筑仍然会被拆除。罚款是针对违法行为的一种处罚方式，并不意味着违法行为得到了合法化或建筑物的合法性得以改变。《城乡规划法》第六十四条规定了对于未取得建设工程规划许可证或未按规定进行建设的建筑的处理方式，包括但不限于责令停止建设、限期改正、处以罚款、限期拆除等措施。如果建筑物无法采取改正措施消除影响或不能拆除，那么将会面临没收实物或违法收入的处罚。因此，即便在缴纳罚款之后，违章建筑也必须遵循法律规定被拆除。
在某些情况下，别墅违建可能不会被拆除：
1、未严重影响主体建筑结构：如果违建不会影响别墅的主体结构，或者不影响相邻建筑物的安全性，那么在一定条件下，可以暂不拆除。
2、利用现有科技条件无法实施拆除：如果违建的位置难以通过常规手段拆除，且无法采用新的技术方法拆除，那么可以暂时不拆除。
3、违建拆除后会严重影响公共利益：如果拆除违建会导致公共利益的严重损失，如涉及国家安全或其他重要设施，那么可以不立即拆除。
4、乡村规划区内的违建：在乡村规划区内，如果没有依法取得相应的建设许可，乡镇人民政府有权责令停止建设，并在必要时拆除违建。
5、特殊情况下的违建：对于一些特定情况的违建，如宅基地上的附属建筑物，只要不违反法律规定，不损害他人权益，一般不会被拆除。此外，如果违建是在1982年前建造的，或者在法定时间内建造且不超过当地宅基地标准，也可能不被拆除。
6、简单附属建筑：如果别墅旁边的简单附属建筑(如车库)不影响公共空间、不损害邻里利益、不违反法律规定，那么政府通常不会对这些建筑提出拆除要求。
7、环保法的特殊规定：如果违建别墅不符合土地利用总体规划和城乡规划，但在2018年底之前符合规划，可以不予拆除，而是予以没收或保留。
8、部分拆除的可能性：如果违建别墅的一部分符合土地利用总体规划和城乡规划，或者拆除会影响相邻建筑的安全、损害无过错利害关系人的合法权益或对公共利益造成重大损害，那么这部分建筑可以被拆除，而不必全部拆除。
9、没收的可能性：如果违建别墅无法采取改正措施消除影响且不能拆除，或者影响了公共利益，那么可以。
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